โครงการพิเศษ โรงเรียนบางบ่อวิทยาคม มีห้องเรียนโครงการพิเศษ 3 โครงการ ดังนี้ โครงการห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์ โครงการพิเศษภาษาอังกฤษ (English Program) โครงการห้องเรียนพิเศษ EIS